По свидетельству старожилов он был необычайной красоты и был изготовлен из белой керамики. Иконостас был полностью уничтожен предположительно в 1920-х или 30-х годах во время антирелигиозной кампании. В подвале удалось собрать значительное количество его осколков, засыпанных песком.

Судя по отпечаткам на многих осколках изготовителем иконостаса в мыщенском храме был владелец известного в то время изразцово-гончарного завода в городе Рыбинске Ярослаской губернии Василий Аксёнов. Представленная на Всемирной выставке в Париже в 1900 году изразцовая печь из Рыбинска была удостоена специальной премии и признана лучшей печью мира.